作者:邵爱华; 薛峰; 陈葵; 朱江暗纹东方纯线粒体nd1侧翼trna序列系统学
摘要:利用提取纯化的暗纹东方纯(rakifugu fasciatoz)肝脏的mtDNA为模板,按红鳍东方纯(rakifugu rubripes)mtDNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,首次克隆并测定了暗纹东方纯mtDNA的ND1亚基及其侧翼的tRNA基因。运用DNA分析软件,对暗纹东方纯与GenBank中选取的几种同目的鱼类的相应序列进行比较分析,显示暗纹东方纯与这些鱼类的各个相应基因具有较高的同源性。利用分子生物学相关软件,对暗纹东方纯及与其同目的6种鱼的ND1基因序列建立NJ和MP分子进化树,并与传统的分类地位进行比较,结果表明与传统的分类地位基本吻合。3个tRNA基因含有69~71个碱基,推定了各个tRNA的二级结构,均具有较为典型的三叶草型结构。
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