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射干内生真菌SRAP-PCR反应条件的优化

作者:罗琴; 赵欢; 彭正松; 刘小红; 钟钒; 邓迪...射干内生真菌相关序列扩增多态型标记单因素优化

摘要:以从射干中分离纯化出的96株内生真菌DNA为研究对象,采用单因素试验设计,对影响SRAP-PCR反应的DNA模板、Mg2+、d NTPs、Taq DNA聚合酶和引物对浓度进行了优化,以确定适合射干内生真菌的SRAP-PCR反应最佳反应体系。结果表明,建立的射干内生真菌最佳反应体系为20μL,反应体系中含10×PCR buffer(不含Mg2+)2.0μL,DNA模板50 ng,Mg2+浓度为2.5mmol·L-1,d NTPs为0.5 mmol·L-1,引物1.0μmol·L-1,Taq DNA聚合酶1.5U。利用该反应体系从90对引物中筛选出可扩增清晰、稳定性好条带的引物38对。该体系为今后利用SRAP分子标记技术开展射干内生真菌的分子遗传学研究奠定基础。

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