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密脉鹅掌柴居群的ITS1和ITS2分子鉴定研究

作者:蒲星宇; 朱高倩; 谭慧; 王丽; 符德欢; 李...密脉鹅掌柴居群its区dna分子鉴定

摘要:目的 对密脉鹅掌柴3个居群内的ITS区DNA序列进行生物信息分析。方法 采用ITS区特异引物ITS4/ITS5对密脉鹅掌柴3个居群进行PCR扩增并测序。结果 密脉鹅掌柴的ITS区全序列总长为658bp,其中ITS1、5.8S和ITS2序列长度分别为223bp、164bp和223bp。在ITS1、ITS2片段上,3个居群的密脉鹅掌柴种间K2P最小遗传距离均大于种内K2P最大遗传距离,NJ系统发育树也显示3个居群的密脉鹅掌柴均可与Genbank数据库中鹅掌柴属17个外源种植物鉴别开,其中ITS2和ITS1序列上分别具有2个和1个有效鉴别位点。结论 ITS1和ITS2序列均适用于密脉鹅掌柴的DNA条形码,且ITS2比ITS1更适合密脉鹅掌柴的分子鉴定。

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