作者：胡雪刚; 邱在玲; 曾建钗; 林诗晗; 樊丽娜...微小rna二代测序表达谱
摘要：目的:探究微小RNA(miRNAs)在人口腔鳞状细胞癌(OSCC)干细胞中的表达及其意义。方法:以CD133为表面标志,应用免疫磁珠法分选TCA-8113细胞中的干细胞、流式细胞术检测,通过克隆形成实验和transwell侵袭实验检测干细胞特性。应用二代测序检测并筛选差异表达的miRNAs。对差异表达miRNAs运用生物信息学方法进行靶基因预测和功能分析。结果:筛选分析得到TCA-8113中的CD133+细胞,较CD133-TCA-8113细胞表达上调超过1.5倍的miRNA有2个;表达下调的有10个。miRanda和RNAhybrid靶基因预测共得到2 490个靶基因,GO注释显示他们主要涉及干细胞分化、血管生成、细胞增殖等功能。Pathway注释显示主要参与Wnt信号途径、癌症途径、FC受体信号途径等信号通路。结论:miRNAs在口腔鳞癌干细胞中存在特异性的表达谱,差异表达miRNAs调控多种具有不同细胞功能和参与不同信号通路的基因。
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