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字符串匹配算法在DNA序列比对中的应用

作者:陈建平字符串匹配dna序列比对哈希算法字典树后缀数组bwt压缩

摘要:高通量测序技术的飞速发展让生物信息领域迎来了大数据时代。新技术在提供海量生物遗传信息的同时,也给分析这些数据带来了新的挑战。DNA序列比对是信息分析流程中的关键步骤,为后续的变异检测提供序列比对信息。2015"深圳杯"数学建模夏令营B题以DNA序列比对为研究课题,希望参赛学生给出序列快速比对的最佳方案。本文简要点评了各参赛队伍的解答情况,然后介绍了现有DNA序列比对软件中用到的算法和数据结构。

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数学建模及其应用

《数学建模及其应用》(CN:37-1485/O1)是一本有较高学术价值的大型季刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《数学建模及其应用》读者对象主要是大、中专院校广大师生,数学建模爱好者及应用数学工作者,也包括对数学建模有兴趣的企事业单位和政府人士。

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