HIV-1整合酶与L708,906抑制剂结合模式及运动性的研究

作者：胡建平 刘嵬 唐典勇 张元勤 常珊整合酶l708906运动模式运动相关性药物设计

摘要：前期工作已用分子对接方法获得了HIV-1整合酶与L708,906抑制剂分子的复合物模型（IN_L708,906）,现从距离、能量和氢键三个方面详细地分析了IN_L708,906模型中的关键残基.结果表明,复合物模型与蛋白质晶体库中整合酶（IN）与5CITEP的结合模式相近.用主成分分析和动力学交叉相关图方法分别研究了IN_L708,906复合物模型和IN单体的运动模式及相关性差异.计算结果显示,L708,906抑制剂的结合使得IN功能loop区残基柔性下降、分子规律性运动的丧失及集团运动相关性的无序增加,这些可能是酶活性下降的主要因素.模拟结果将有利于基于芳香二酮酸类的抗HIV药物设计.

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