蚊子全基因组中微卫星的丰度及其分布

作者：余泉友; 李斌; 李关荣; 房守敏; 颜虹; 童...微卫星按蚊基因组丰度分布

摘要：微卫星是近年大力开发的一种遗传标记,为推进按蚊遗传学相关研究,对按蚊全基因组中由1～6个碱基重复单元组成的简单序列重复(微卫星)进行了分析.进而对其微卫星的丰度和分布进行了比较分析,也比较了染色体各个区域(外显子、内含子和基因间隔区)之间的分布差异.微卫星在按蚊基因组中的比例约占2.14%,其中X染色体拥有微卫星的密度最大.对按蚊基因组中微卫星丰度而言,A碱基和C碱基重复在基因组中丰度相似,AC单元的丰度是AG单元的两倍多,然而AT和CG单元非常稀少;对于三四碱基而言,AGC,AAAC和AAAT单元最为丰富,ACG,ACT,AGG,CCG,ATGC,CCCG,ACTG,AACT,ACGT,AGAT,CCGG,ACCT和AGCT单元等均很稀少,而一些五碱基重复,在某条甚至某几条染色体中均未分布.除两碱基重复单元在2L的外显子区域丰度较高外,其他重复单元均在内含子和基因间隔区丰富.进一步分析显示,微卫星在每条染色体两臂的丰度和分布存在着很多的相似性.

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