作者:洪跃辉; 李文哲; 陈栋华; 薛金满; 王江海无色杆菌细胞色素p450生物信息学
摘要:采用生物信息学方法分析无色杆菌HZ01细胞色素P450的理化参数、开放阅读框、系统进化树、亲疏水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构和蛋白功能域。结果表明,P450基因中最长的开放阅读框长度为2355 nt;序列中有较多区域表现出亲水性,不存在信号肽;与木糖氧化无色杆菌的P450亲缘关系较近。该P450可能是可溶的非跨膜蛋白;在其二级结构中,无规卷曲所占比例最高;根据三级结构模型推断该P450属于球状蛋白;预测出该P450含有2个低复杂区域。本研究揭示了无色杆菌HZ01细胞色素P450的基本性质,有助于后续进行更深入的研究,为该P450的应用奠定了基础。
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