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舟山近海水样环境DNA获取方法的建立

作者:陈治; 宋娜; 源利文; 邬倩倩; 高天翔环境dna获取方法曼氏无针乌贼舟山近海水域

摘要:以曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)为研究对象,通过绝对定量技术建立和优化了舟山近海高浊度水样环境DNA(Environmental DNA,eDNA)的获取方法。研究结果如下:(1)同体积水样采用乙醇沉淀法获得的eDNA产量是滤膜抽滤法的1.76—2.53倍,但在实际应用中由于受到采样体积、处理方式、配套设备的限制,乙醇沉淀法难以发挥出优势;(2)滤网对泥沙等杂质无过滤作用,添加滤网并不能过滤掉泥沙及增加抽滤体积;(3)滤膜孔径的大小对少量水样的eDNA产量有很大影响,但对大体积水样eDNA的产量无影响;(4)水样静置处理有可能会增大eDNA产量,但也有可能会增大eDNA结果的波动性,使生物量评估结果误差较大;(5)阳离子表面活性剂对eDNA降解有明显的抑制作用;(6)去膜法效果优于碎膜法,建议使用去膜法进行eDNA消化,使用时增加离心时间;(7)酚抽除沙法虽然不能提高eDNA产量,但能明显提高产物纯度。研究首次建立了舟山近海水样大生物eDNA最适获取方法,为相似水域的水样采集及eDNA提取提供了借鉴参考。

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水生生物学报

《水生生物学报》(CN:42-1230/Q)是一本有较高学术价值的农业期刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《水生生物学报》主要刊登:与水生态的评价与治理;水生物的生化、遗传、病理、毒理和分类区系;水生物的育种、培养、开发利用和病害防治;渔业生物学报及有关湖沼学的综合调查与研究等相关的中、英文研究论文、研究简报及综述。

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