作者：郭国军; 赵银丽; 刘变枝; 王杰; 孙向丽; ...鲤序列特征组织表达谱生物学功能
摘要：先前研究表明let-7a为鲤（Cyprinus carpio）脾脏高丰度mi RNA,但其功能尚不清楚。为全面了解鲤let-7a的潜在生物学功能,研究分析了其成熟序列特征、组织表达谱和靶基因富集情况。结果显示,let-7a在鲤脾脏中存在序列长度变异和碱基替换,长度为18—25 nt,碱基替换类型有9种,种子区序列碱基替换率达2.1%。表达谱分析表明,let-7a为广泛性高丰度mi RNA,具明显的时序表达特征,其在鳃、肠、脾脏和肾脏等免疫相关器官中的表达水平明显高于其他器官。GO富集分析显示,let-7a与转录调控、细胞刺激应答、离子转运、跨膜运输、蛋白质氨基酸磷酸化和细胞迁移等生物学过程密切相关,尤其是靶基因GO term在刺激应答相关的许多生物学过程显著富集。总之,鲤let-7a可广泛参与多种生物学过程调控,尤其是机体各种刺激应答。
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