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基于线粒体COⅠ基因序列的东南沿海可口革囊星虫遗传多样性分析

作者:金丹璐; 娄剑锋; 高心明; 侯聪聪; 竺俊全...可口革囊星虫遗传多样性遗传结构

摘要:为了解我国东南沿海可口革囊星虫自然群体的遗传多样性及遗传结构,以线粒体COⅠ基因为分子标记,对浙江象山(XS)与温岭(WL)、福建宁德(ND)、广东湛江(ZJ)4个可口革囊星虫自然群体的80个样本的COⅠ基因片段进行PCR扩增、序列测定和分析。结果表明,在815 bp长度的核苷酸片段中,A、T、C、G碱基的平均含量分别为29.8%、31.0%、22.6%和16.6%,A+T含量(60.8%)高于C+G含量(49.2%),表现出较强的AT偏好性。共检测到29个核苷酸变异位点,定义了29种单倍型,总群体单倍型多样性指数(H_d)、核甘酸多样性指数(P_i)及平均核苷酸差异数(K)分别为0.932、0.0036及2.8902,表现出高的H_d和低的P_i。单倍型邻接关系树的拓扑结构简单,未呈现明显的地理谱系结构。群体内的遗传距离为0.0027—0.0040,群体间的遗传距离为0.0032—0.0040。两两群体间的遗传分化系数(F_(st))和分子方差分析(AMOVA)表明,可口革囊星虫的遗传变异主要来自于群体内,而群体间无显著分化。中性检验和核苷酸不配对分布结果揭示,可口革囊星虫经历了群体历史扩张事件,大致发生在4.6万年前的更新世晚期。

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水生生物学报

《水生生物学报》(CN:42-1230/Q)是一本有较高学术价值的农业期刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《水生生物学报》主要刊登:与水生态的评价与治理;水生物的生化、遗传、病理、毒理和分类区系;水生物的育种、培养、开发利用和病害防治;渔业生物学报及有关湖沼学的综合调查与研究等相关的中、英文研究论文、研究简报及综述。

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