作者:张世勇; 钟立强; 秦钦; 王明华; 潘建林; ...斑点叉尾鲴ghrhsnpsnapshot生长性状单倍型分析关联分析
摘要:研宄旨在探讨生长激素释放激素基因(Growth hormone-releasing hormone, CHRH)对斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)生长性状的影响.采用DNA混池测序法筛选GHRH基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点,使用SNaPshot法将筛选到的SNPs多态性位点进行分型,并对这些位点进行连锁不平衡和单倍型分析.结果表明,在GHRH基因内含子区域共检测到4个SNPs位点,并成功地对3个位点进行了分型,3个位点间均不存在强连锁不平衡;3个SNPs位点在176尾斑点叉尾鲴中形成了6种有效单倍型.关联分析表明SNP位点g.6301 G〉A的AA基因型的体质量显著性地高于AG和GG型(P〈0.05),比群体的平均体质量高14% .单倍型组合H1/H4和H1/H5个体的体质量和体长极显著性地高于其他单倍型组合(P〈0.01),体质量比群体平均体质量分别高30 %和15%,体长比群体平均体长分别髙7%和6% .研宄为斑点叉尾鲴生长性状分子标记辅助选育和QTL定位提供了参考依据.
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