作者：陈俊粤; 龚一富; 马颖瑞; 周丽亚; 王何瑜绿色杜氏藻生物信息学
摘要：异戊烯基焦磷酸异构酶（isopentenyl diphosphate isomerase,Dv IPI）是绿色杜氏藻中类胡萝卜素等萜类物质合成过程中甲羟戊酸途径（mevalonate pathway,MVA）通路上一个重要的限速酶。实验中获得绿色杜氏藻IPI基因的全长序列（Gen Bank序号：KX189195）,该基因全长4 641 bp,开放阅读框（ORF）为1 147 bp,编码382个氨基酸,并含有3个CBS结构域。蛋白质预测结果表明,Dv IPI分子呈亲水性,不含信号肽,也不存在跨膜区域;同时,Dv IPI中α-螺旋所占比例最高,中部呈现不规则的扭曲缠绕,两边各自有一个扭曲的多肽链单独远离中心。系统进化树分析显示,Dv IPI与细菌IPI亲缘关系较近,而与被子植物以及其他藻类IPI亲缘关系较远。定量检测结果与RT-PCR结果表明,茉莉酸甲酯（methyl jasmonate,Me JA）浓度为50~100μmol/L时,对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素含量、叶绿素含量以及绿色杜氏藻IPI基因表达水平的影响最为明显,且三者的变化趋势基本一致,推测Me JA对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素、叶绿素的诱导作用可能与绿色杜氏藻类IPI基因有关。
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