作者:高雷 齐斌 朱平混沌游走方法rhd基因经典hp模型马尔可夫模型概率矩阵
摘要:利用基于经典HP模型的蛋白质序列混沌游走方法(chaos game representation,CGR),给出了RHD基因的蛋白质序列CGR图,可视作蛋白质序列二级结构的一个特征图谱描述.对临床上的血型鉴别有一定的参考价值.另外.还根据由Jeffrey在1990年提出的描绘DNA序列的CGR方法,给出了RHD基因的DNA序列的CGR图.并且根据RHD基因DNA序列的CGR图算出了尺日D基因相应的马尔可夫两步转移概率矩阵,从概率矩阵表可以看出RHD基因对编码氨基酸的三联子的第3个碱基的使用偏好性.
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