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应用抑制性消减杂交技术筛选双环醇调节靶基因

作者:王建军; 纪冬; 成军; 刘妍; 杨倩; 党晓燕...抑制性消减杂交技术ssh双环醇调节靶基因肝细胞

摘要:目的:应用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建双环醇处理的人肝癌细胞系HepG2差异表达基因的cDNA消减文库,筛选并克隆双环醇调节相关基因,阐明双环醇对肝细胞调节作用的分子生物学机制。方法:以双环醇处理HepG2细胞,同时以二甲基硫氧化物(DMSO)处理的相同细胞系作为对照;24h后制备细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaⅠ酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性多聚酶链反应(PCR),将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析。结果:成功构建双环醇处理HepG2细胞差异表达基因的cDNA消减文库,文库扩增后得到46个白色克隆,进行菌落PCR分析,均得到200-1000bp插入片段,挑取含有插入片段的30个克隆进行测序,并通过生物信息学分析获得14种已知基因序列,结论:应用SSH技术成功构建了双环醇处理HepG2细胞差异表达基因的cDNA消减文库,该文库的建立为进一步阐明双环醇在体内的调节机制提供依据。

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世界华人消化

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