基于分子网络的癌症基因与非癌症基因的差异性分析

作者：聂亚玲 余景开蛋白质相互作用癌症基因节点度介数最大连接组件

摘要：研究人类蛋白质相互作用网络中，癌症基因和非癌症基因在拓扑结构上的差异性，进而为潜在的癌症基因挖掘提供重要依据。首先利用多个数据库，构建一个较为全面的人类蛋白质相互作用（protein—protein interaction，PPI）网络，并搜集已知癌症基因；然后从PPI网络中抽取大量随机样本，并分别统计分析随机样本和已知癌症基因在节点度、节点介数和最大连接组件上的差异程度。得到了如下结果：（1）构建了一个较为全面的人类蛋白质相互作用网络；（2）获得乳腺癌已知癌症基因集；（3）已知癌症基因集和PPI网络随机样本在节点度、节点介数以及最大连接组件等拓扑结构属性上差异有显著性（P〈2．2×10^（-16））。PPI网络的节点度、节点介数和最大连接组件等拓扑结构属性能够显著地区分癌症基因与非癌症相关基因，为新的未知癌症基因的发掘提供了重要考察依据。

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