作者：黄飘逸; 马海涛; 喻子牛; 张跃环; 高红梅...熊本牡蛎微卫星标记野生群体养殖群体通用性
摘要：利用高通量测序的方法,从熊本牡蛎基因组中开发了20对具有多态性的微卫星标记,通过微卫星标记位点比较了野生群体和养殖群体的遗传多样性。野生群体中,所有位点共扩增出330个等位基因,等位基因数(N_a)范围为6~39,平均等位基因数为16.5000;有效等位基因数(N_e)范围为1.3529~33.3617,平均值9.5172;观测杂合度(H_o)范围为0.2000~1.0000,平均值0.6715;期望杂合度(H_e)范围为0.2656~0.9877,平均值0.8321;ShannonWeiner指数(Ⅰ)范围为0.6483~3.5858,平均值2.2769;多态信息含量(PIC)范围为0.2545~0.9692,平均值0.8035,共有16个位点符合Hardy-Weinberg平衡。养殖群体中,N_a平均值为10.2500,N_e平均值为5.8434,H_o平均值为0.6391,H_e平均值为0.7636,I平均值为1.7914,PIC平均值为0.7207。结果显示,熊本牡蛎养殖群体的遗传多样性低于野生群体,但仍然维持在高度多态水平。研究表明,在熊本牡蛎人工繁育过程中,使用大数量的亲本进行繁育,可有效防止选育群体的遗传多样性降低,但人工选育对选育群体的遗传多样性也产生了一定的影响。另外,分析了这些引物在近缘种葡萄牙牡蛎、长牡蛎、香港牡蛎、有明牡蛎、僧帽牡蛎、咬齿牡蛎以及舌骨牡蛎中的通用性情况,发现XB1-6、XB1-39和XB1-453个位点在8个物种中均能扩增出目的条带,XB1-41仅能在熊本牡蛎中扩增出目的条带。
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
