作者:龚小玲; 鲍宝龙; 杨桂梅; 任大明牙鲆变态早期全长cdna文库锚定pcrparvalbumin基因钙离子结合蛋白
摘要:在前期的研究中,克隆到牙鲆变态早期和变态前差异表达的parvalbumin基因片断cDNA.为了克隆parvalbumin基因的全长cDNA, 构建了变态早期 (孵化后23 d仔鱼) 牙鲆头部的全长cDNA文库,并对文库的滴度和插入片段大小进行了评估.同时采用锚定PCR法从cDNA文库筛选出parvalbumin 基因的全长cDNA.结果表明,所构建的牙鲆变态早期头部cDNA文库的滴度为1.2×106 PFU·mL-1,插入片段的平均长度为1 000 bp左右.parvalbumin基因的全长cDNA的长度为603 bp, 编码109个氨基酸,含有两个EF手型钙离子结合域:DQDGSGFIEEEEL (52~64)和DSDGDGKIGVEEF(91~103),以及一个ATP/GTP结合位点模序:ACGLAGKS(33~40),是一种典型的钙离子结合蛋白.通过parvalbumin基因氨基酸序列的同源比较分析表明,牙鲆parvalbumin基因是比较保守的蛋白,与其它鱼类享有61.5%~68.8%序列同源.系统分析表明,牙鲆的parvalbumin基因与狭鳕(Theragra chalcogramma)最为接近.
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