作者：车海彦; 曹学仁; 刘勇; 罗大全小rna深度测序海南南瓜病毒病
摘要：2016年在海南乐东、昌江、澄迈、海口、文昌、儋州等地采集疑似被病毒病感染的南瓜叶片样品6个,将样品合并,采用小RNA深度测序技术对上述混合样本的病毒种类进行鉴定,发现样本中含有黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus,CMV）、番木瓜环斑病毒（Papara ringspot virus,PRSV）、黄瓜绿斑驳病毒（Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV）和中国南瓜曲叶病毒（Squash leaf curl China virus,SLCCNV）,通过PCR方法进一步验证了深度测序结果的准确性。SLCCNV在4个样品中存在,P-CJ分离物的DNA-A和DNA-B组分全长分别为2 735 bp（登录号为MF062251）和2 722 bp（登录号为MF062252）。DNA-A和DNA-B组分均与SLCCNV分离物的同源性最高,同源性分别为89.2%~99.3%和79.1%~98.8%;P-CJ分离物与从中国植物样品中分离到的SLCCNV聚在同一进化分支上。上述研究结果表明,P-CJ是SLCCNV的一个分离物。
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