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首页 期刊 热带作物学报 11种热带植物EST-SSR标记的开发和多样性分析【正文】

11种热带植物EST-SSR标记的开发和多样性分析

作者:黄启星 左娇 孔华 郭运玲 周霞 郭安平热带植物estssr微卫星

摘要:对11种热带植物的640 863条表达序列标签(ESTs)进行分析,发掘出13 916个EST-SSR位点,平均分布频率约为109.37个/Mb,主要特点表现为:(1)不同物种间的EST-SSR丰度存在明显差异,其中菠萝EST-SSR位点最为丰富(201.75个/Mb);芒果EST-SSR位点丰度最低(49.55个/Mb);(2)二、三核苷酸基元的SSR最为常见,两者占总数的88.68%。其中,AG/CT、AT/AT和AAG/CTT在不同基因组区域都是占优势的SSR类型;(3)SSR在基因组不同区域分布丰度存在很大差异。其中,麻疯树基因组SSR(gSSR)的丰度是EST-SSR丰度的17倍多;(4)保守基因内AG/CT重复的SSR极其丰富。此外,设计了一批具有物种特异性的EST-SSR PCR引物。

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热带作物学报

《热带作物学报》(CN:46-1019/S)是一本有较高学术价值的大型月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《热带作物学报》以“立足海南、服务热区、面向全国、放眼世界、林实际出发,努力把学报办成有特色的、反映热区农业领域科研成果的国际性高水平学术期刊”为办刊宗旨,全面系统报道关于天然橡胶、木薯、咖啡、剑麻等热带作物的科研成果。

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