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宫颈癌组织HPV16 URR及E7基因突变和序列多态性分析

作者:赵雪珍 王言奎 彭丽娜 张红宫颈肿瘤人乳头瘤病毒16调控序列核酸聚合酶链反应

摘要:目的分析山东省青岛地区妇女宫颈癌组织中人乳头瘤病毒16型(HPV16)上游调控区(URR)和E7开放读码框(OFR)基因突变和基因序列多态性。方法收集山东省青岛地区妇女宫颈癌标本共111例,提取DNA作为模板,应用通用引物和型特异引物经聚合酶链反应(PCR)筛选HPV16阳性标本,PCR结合测序检测HPV16阳性标本URR和E7基因全序列,经DNAStar 100软件和在线BLAST分析其变异情况。结果宫颈癌组织中HPV和HPV16感染率分别为99.10%(110/111)和73.63%(81/110);核苷酸水平上HPV16 URR形成24种变异模式,同源性在98.02%~99.26%之间,nt7518 G→A和nt7861 A缺失变异率均为100%(26/26)。HPV16E7形成12种变异模式,同源性在99.23%~100%之间;nt647 A→G突变率58.54%(24/41),氨基酸由Asn→Ser(N29S)、nt666 G→A突变率24.39%(10/41),为同义突变。结论山东省青岛地区妇女宫颈癌组织中HPV16URR和E7基因均存在变异;HPV16 URR突变热点为nt7518和nt7861,HPV16 E7突变热点为nt647,且二者尚存在未见报道的变异位点。

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