作者：孙忠辉; 张丹露; 祝英; 郭韫懿; 陈静华; ...人乳头状瘤病毒基因型序列进化树
摘要：目的了解上海郊区人乳头状瘤病毒（HPV）6型L1基因在不同疣组织（尖锐湿疣和寻常疣）结构特点和变异规律,为临床治疗和预防提供理论依据。方法采用PGMY09/11通用引物扩增的方法进行HPV基因分型,8例尖锐湿疣和2例寻常疣HPV 6型阳性标本再进行L1基因直接测序;测序结果进行BLAST;然后;进一步用Geneious软件对测序结果与Gen Bank中的其他国家及国内的HPV6型病毒株L1基因序列比对,同时进行进化树构建。结果与参考株X00203相较共出现11种同义突变和3种错义突变。从BLAST结果和构建的系统进化树图可以看出,本地区HPV6型病毒株中,样本13639、14960、15987和15989是HPV6的A型;14300、16320、14304、15976、15982和15330是HPV6的B1型。结论本地区皮肤疣感染的HPV6型4株为A系,6株为B1亚系,与国内外HPV6型病毒株基因都有同源性背景。
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