作者:王杨; 孙玉萍; 董琦; 杨颖; 刘颖; 于婷乔...拟南芥生物信息学非生物胁迫端粒酶活性
摘要:端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase, TERT)是真核细胞中具有逆转录酶活性的核糖核蛋白复合物-端粒酶(telomerase)的主要组成成分。拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtTERT是第1个被克隆的植物端粒酶逆转录酶基因。为了明确AtTERT的结构和功能特点,本研究利用生物信息学和软件对AtTERT的理化性质和蛋白质结构等进行了系统分析,探讨了不同物种间TERT的亲缘关系;同时对盐和氧化胁迫下端粒酶活性和AtTERT基因表达模式进行分析。结果表明:AtTERT属于不具有信号肽的亲水性蛋白,未发现明显的跨膜结构域。AtTERT磷酸化位点有125个,其中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点分别为87、28和10个。无规则卷曲和α-螺旋是AtTERT二级结构的主要结构元件。保守结构域为端粒酶RNA结合功能域(telomerase RNA binding motif, TRBD)和逆转录酶功能域(telomerase reverse transcriptase motifs, RT)。端粒酶活性变化与AtTERT表达对盐与过氧化氢胁迫反应一致,均呈现先升高后降低的趋势。该研究结果为研究植物TERT的结构功能积累了新的资料。
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