作者：陈耀峰; 谢可嘉; 张长超; 王宁; 李辉; 王...启动子功能性snp
摘要：载脂蛋白B （apolipoprotein B, ApoB）在极低密度脂蛋白（very low density lipoproteins, VLDL）组装、转运以及脂类代谢中都具有重要作用。本课题组前期研究发现鸡（Gallus gallus） ApoB基因g.-112A〉G单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）与鸡腹脂重和腹脂率显著相关。生物信息学分析显示，该SNP位于鸡ApoB基因的启动子区，可能是功能性SNP。为确定该SNP的功能性，本研究开展了该位点不同基因型与血清生化指标的相关分析；比较了ApoB基因3种基因型在鸡肝脏和小肠中的表达水平；构建了含该SNP位点A和G等位基因的启动子报告基因载体，并利用双荧光素酶报告系统分析候选转录因子TATA-box binding protein （TBP）和CCAAT/enhancer binding protein alpha （C/EBPα）对该SNP位点不同等位基因荧光素酶活性的影响。关联分析结果显示，携带GG基因型的公鸡高密度脂蛋白（high-density lipoprotein, HDL）/低密度脂蛋白（low-density lipoprotein, LDL）显著高于AA型个体（P＜0.05）；qRT-PCR结果显示，在鸡肝脏和小肠组织，AG基因型的ApoB基因表达量显著低于AA和GG基因型（P＜0.05）；报告基因检测结果显示，A等位基因荧光素酶活性显著高于G等位基因（P＜0.05）。此外，转录因子TBP和C/EBPα对A等位基因荧光素酶活性的促进作用强于G等位基因（P＜0.05）。上述结果提示，ApoB基因g.-112A〉G可能是功能性SNP位点，可初步确定其为优质鸡育种的功能性分子标记。本研究为深入探讨ApoB基因在脂肪生长发育中的功能提供了实验数据。
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