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光唇鱼MSTN基因克隆、组织表达及SNP位点筛查

作者:苗亮; 李明云; 潘娜; 穆方申; 侯红红; 王...光唇鱼组织表达snp

摘要:肌肉生长抑制素(myostatin, MSTN)是骨骼肌生长的负调控因子,MSTN基因在遗传育种上有很大的潜在应用价值。光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)是一种具有较大开发前景的经济鱼类,但其生长速度较慢。为了解光唇鱼MSTN基因的特征并为生长性状标记辅助选择提供基础资料,本研究克隆了光唇鱼MSTN cDNA和基因组DNA序列、检测了组织表达情况并进行了单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点筛查。结果表明,光唇鱼MSTN cDNA序列全长2 163 bp,含有一个1 128 bp的开放阅读框(open reading frame, ORF)、编码375个氨基酸,预测的编码蛋白具有脊椎动物MSTN的序列特征(如含有1个蛋白酶水解位点RIRR、C端有9个保守的半胱氨酸残基)。基于MSTN氨基酸序列的比对显示不同鱼类之间MSTN序列同源性较高(>80%),而鱼类与其他脊椎动物同源性较低(65%左右);光唇鱼与其他鲤科鱼类的MSTN基因高度同源(>96.5%)。系统进化树中鱼类聚为一枝、其他脊椎动物聚为另一枝,光唇鱼MSTN位于鲤科鱼类的小簇中。半定量RT-PCR检测显示,MSTN mRNA在光唇鱼脑和肌肉中高表达、肠和肝脏中有微弱表达、其他组织中均未见表达。光唇鱼MSTN基因的DNA序列全长5 828 bp,含有3个外显子和2个内含子,在第二内含子中检测到10个SNP位点,但与生长性状(体重、体长)不存在显著相关性(P>0.05)。研究结果为探究光唇鱼MSTN基因的功能和筛选生长性状相关辅助育种标记提供了参考资料。

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农业生物技术学报

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