作者：陈勇兵 王燕 张海利热胁迫生物信息学系统发育关系
摘要：热激转录因子（heat shock transcription factor,Hsf）已经被证实是广泛地存在于植物细胞内的一类重要的转录调节基因,对植物抵抗高温逆境伤害和其他生命活动具有重要作用.本研究利用番茄（ycopersicon esculentum）全基因组测序结果,鉴定番茄Hsf家族成员;通过生物信息学方法,分析其系统发育关系和染色体定位;利用已有的番茄芯片数据和qRT-PCR进行组织表达谱和基因表达响应分析.结果表明,番茄基因组含有25个Hsf基因家族成员,序列比对揭示其均具有转录因子特有的DNA结合域（DNA binding domain,DBD）;根据拟南芥（Arabidopsis thaliana）、水稻（Oryza sativa）和黄瓜（Cucumis sativusL.）Hsf的基因结构和系统发育树将这些转录因子分为3个分支（A、B和C）,细分为15个亚分支（A1～A9、B1～B4以及C1～C2）.染色体定位结果表明,25个Hsy基因除Chr.1和Chr.5外,其余不均匀分布在剩余10条染色体上.各个发育阶段表达谱分析表明,Hsy基因具有不同的表达模式,近一半的基因处于高表达水平.qRT-PCR分析表明,大多数Hsf家族成员参与番茄苗期应对高温热激反应.研究结果为揭示番茄Hsf基因的功能提供基础资料。
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