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花生矮化病毒(PSV)Mi株系RNA3全序列分析

作者:许泽永; 晏立英; 陈坤荣; MarcelPrins花生矮化病毒全序列分析rna3株系序列同源性开放阅读框架psvvirus核苷酸序列氨基酸序列and运动蛋白cp基因壳蛋白变异性er全长cpr区

摘要:完成了中国花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)Mi株系RNA3全序列分析。PSV—MiRNA3全长2170个核苷酸,含两个开放阅读框架(ORE),分别编码3a运动蛋白和壳蛋白(CP)。PSV-MiRNA3核苷酸序列和PSV亚组IER和J株系同源性为77.7%和78.5%,与亚组ⅡW株系同源性为76.7%;同一亚组ER和J株系RNA3序列同源性为91%。PSV—Mi3a和cp基因与PSV-ER,J and W株系同源性分别为78.3%~79.3%和74.4%~77.8%。PSV-Mi 3a和CP蛋白氨基酸序列与PSV-ER,J and W株系同源性分别为73.90%-77.4%和64.80%-77.5%。PSV-Mi RNA35’UTR和IR区域有较大的变异性,与PSV—ER,J and W株系序列同源性分别为78.4%79.8%和70.2%。73.2%,明显低于亚组Ⅰ、Ⅱ两个亚组间株系在这两个区域序列同源性。上述结果说明我国PSV Mi株系不同于已报道的PSV两个亚组,独自构成一个新亚组,即亚组Ⅲ。

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农业生物技术学报

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