基于SVM整体分类器的Ca2＋和Mn2＋配体结合残基的识别

作者：张晓瑾; 胡秀珍; 曹晓勇; 陈宇翔金属离子配体svm算法整体分类器结合位点

摘要：金属离子配体与蛋白质的相互作用, 在诸多重要的生命进程中实现了不可替代的生物学功能, 配体结合残基的预测对蛋白质生物功能的理解及药物设计有重要意义.工作中选取了C a 2＋和 Mn 2＋配体的结合残基数据集, 从序列信息出发, 提出了-种基于S VM 整体分类器的预测方法.对C a 2＋ 配体结合残基, 组合3分类器预测的总精度达到了7 1. 4 5%, 马氏相关系数达到了0. 4 3 1; 对 Mn 2＋配体结合残基, 组合5分类器预测的总精度达到了8 1. 0 0%, 马氏相关系数达到了0. 6 2 0.

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