应用SNaPshot技术对桉树SNP的检测

作者：周长品; 翁启杰; 甘四明; 姬红霞; 陈升侃...单核苷酸多态性snapshot遗传多样性桉树

摘要：【目的】SNaPshot是一种单核苷酸多态性（SNP）检测的多重分析技术,具有检测速度快、准确性高、成本低廉等特点。利用多重PCR技术,结合SNa Pshot分型方法,在桉树中构建SNP复合分型检测体系,促进SNP技术在桉树遗传图谱构建和无性系鉴定的应用。【方法】利用桉树已有的EST序列设计引物,通过PCR产物直接测序进行SNP标记位点的开发,利用多重PCR技术和SNaPshot分型方法建立SNP复合分型检测体系,并在尾叶桉和细叶桉作图群体的两亲本和6个F1子代,以及16个国内常用的桉树无性系中进行分型检测。【结果】共设计合成12对SNP引物,分为3组（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ）建立了SNP复合分型检测体系,SNP分型情况与测序结果一致。对桉树作图群体的两个亲本和6个F1子代的分型结果进行统计,发现12个SNP标记在6个子代中均发生了分离;对桉树无性系进行多态性的分析,期望杂合度（He）为0.11-0.51、观测杂合度（Ho）为0.11-0.56,多态性信息含量（PIC）为0.10-0.37,表现为中度或低度多态性。【结论】利用多重PCR和SNa Pshot技术可以快速地对桉树进行基因分型,其结果准确可靠,可以用于桉树遗传图谱的构建以及桉树无性系的鉴定等方面研究。

注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社