作者：周浩; 龙北国; 张文炳; 江丽芳; 陈丽丹; ...s2基因序列分析
摘要：目的 测定SARS冠状病毒GD322株S2基因序列并对SARS-CoVS2基因进行系统进化树分析。方法用RT-PCR法从SARS-CoV GD322株基因组中扩增S2基因片段并克隆至pGEM—T载体，转化大肠杆菌DH5a株后测序。利用Lasergene、ClustalX、DNAman和Treeview等软件，将基因序列翻译成氨基酸序列后，与早、中、晚期各地暴发的SARS-CoVS2蛋白序列进行比对，构建系统进化树，并在Internet网数据库中对S2蛋白氨基酸序列进行T细胞抗原表位预测。结果随着SARS-CoV的传播流行，S2基因趋于稳定，晚期的SARS-CoVS2基因的同源性达到99．9％。T细胞抗原表位预测发现。SARS-CoVS2蛋白第57位氨基酸突变对T细胞抗原表位有影响。结论SARS流行过程中SARS-CoVS2基因较为稳定，S2蛋白57位氨基酸的突变可影响病毒T细胞抗原表位。
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