作者：孙芳芳; 聂迎彬; 马松梅; 魏博; 吉万全梭梭白梭梭its序列cpdna序列物种分化分子系统关系生态位分化
摘要：【目的】基于nr DNA和cp DNA 2种基因,探讨中国同域分布的梭梭和白梭梭的物种分化,分析2种基因的单片段及其片段组合对2种植物的物种鉴别力,并分析生态位分化的程度及其对物种进化的影响,为梭梭和白梭梭的系统发育和谱系地理等研究提供基础数据。【方法】基于2个nr DNA序列(ITS2、ITS1-ITS4)和3个cp DNA非编码区序列(trn S-trn G、rps4和trn V),对古尔班通古特沙漠南缘同域分布的梭梭和白梭梭共30个个体进行序列分析;利用距离法(基于Kimura 2-parameter)研究2种植物的遗传分化;基于贝叶斯方法分析个体间的分子系统关系;并利用距离法、系统发育树法、BLAST比对法和诊断特征法评价ITS和cp DNA的单序列及其组合对2种植物的物种鉴别力。在此基础上,利用生态位分析软件ENMTools V1. 4定量分析梭梭与白梭梭生态位分化的程度。【结果】1)对于梭梭和白梭梭,2个ITS序列拼接比对的总长均为1 117 bp,G+C含量平均分别为34. 74%和34. 82%,总的信息位点数分别占片段总长的2. 33%和1. 43%;3个cp DNA序列拼接比对的总长均为2 344 bp,G+C含量平均分别为59. 62%和59. 39%,信息位点数分别占片段总长的0. 68%和0. 43%。2)基于ITS和cp DNA序列组合构建的贝叶斯系统发育树都表明梭梭和白梭梭各聚为一支。3)基于ITS和cp DNA序列组合计算的2种植物的种间最小遗传距离均大于种内的最大遗传距离,并且种间种内都存在1个明显的距离间隙,表明本研究所用的ITS和cp DNA的序列组合可以作为鉴定梭梭和白梭梭的DNA条形码序列。4)基于4种方法评价的ITS和cp DNA序列对梭梭和白梭梭的物种鉴别力表明:2个ITS的单序列及其序列组合的鉴别率均为100%;cp DNA序列中,rps4的单序列及其与trn S-trn G,trn V的两两序列组合的鉴别率均为0,而trn S-trn G,trn V的单序列及其序列组合,以及trn S-trn G+trn V+rps4组合的鉴别率均为100%。5)生态位参数D值�
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