Gromacs在神威蓝光超级计算机上的部署及应用

作者：朱效民; 尚远; 王利神威蓝光分子动力学模拟副本交换gromacs软件包

摘要：Gromacs是一个大型的分子动力学模拟软件。国家超算济南中心拥有两套高性能计算系统，分别为基于IntelCPU构建的高性能计算集群（理论峰值超过100T），以及基于国产SW1600CPU构建的MPP超级计算系统（理论峰值超过1P）。本文介绍了Gromacs软件包在两个高性能计算平台的移植、部署，并以生物大分子作为实例在两个平台上进行了分子动力学模拟测试。

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