基于深腾7000的NAMD千核性能分析

作者：刘倩; 金钟; 何平; 刘继凤; 张宝花性能分析千核深腾7000namd

摘要：NAMD是美国伊利诺伊大学厄本纳-香槟分校(University of Illinois at Urbana-Champaign,UIUC)开发的著名大规模分子动力学并行计算软件包,NAMD是当前用来在分子水平上进行生命过程模拟研究的主要软件之一。我们在中国科学院计算机网络信息中心的"深腾7000"百万亿次超级计算机上进行了移植和优化,并对STMV典型的烟草花叶卫星病毒进行了2048处理器核的模拟计算,计算测试表明取得了较好的加速效果。

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