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用生物信息学方法发现跨染色体剪接的嵌合5′/3′UTRs

作者:张治华; 张勇; 石宝晨; 邓巍; 赵屹; 陈润...染色体生物信息学剪接rna二级结构嵌合mrna多序列比对调控作用翻译过程比对分析区域检测预测算法可信度特异性

摘要:mRNA的5′/3′UTRs是在mRNA翻译过程中起重要调控作用的序列,在5′/3′UTRs上不正常的剪接模式可能导致多种严重疾病.提出了一种基于大规模序列比对分析搜寻5′/3′UTRs跨染色体剪接现象的方法,并用此方法得到8例可信度高的跨染色体的5′/3′UTRs剪接事件,从信息的角度证实了来自不同染色体序列剪接成为5′/3′UTRs的现象是真实存在的.对这8例跨染色体剪接产生的5′/3′UTRs用多序列比对在剪接区域没有发现一致保守的motif.同时,目前的预测算法也不能在剪接区域检测到特异性的RNA二级结构,因此很难确定引导5′/3′UTRs跨染色体剪接的信号.

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科学通报

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