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疏叶骆驼刺耐盐基因AsNHX的3′-RACE克隆及序列分析

作者:努尔凯麦尔·木拉提; 帕尔哈提·阿布都克日...骆驼刺cdna生物信息学

摘要:通过Trizol法提取骆驼刺叶片总RNA的方法,反转录合成c DNA,PCR扩增得到一条600-800bp的DNA条带,与报道的Asp NHX1基因的核心序列基本相符,经3′-RACE扩增的DN段并连接到载体上进行测序.测序结果显示c DNA长度为1484bp,编码470个氨基酸,与猪毛菜Sa NHX1(Salsola affinis)、梭梭Ha NHX1(Haloxylon ammodendron)、盐爪爪Kf NHX1(Kalidium foliatum)的核苷酸序列同源性高达96%、89%、89%,氨基酸序列同源性达到97%、93%和90%.生物信息学分析显示As NHX蛋白的分子式为C4578H7674N1484O1907S291,蛋白的分子量为123347.5,理论等电点p I为5.01,不稳定参数为46.41,是一个富含疏水性氨基酸的不太稳定蛋白,理论上有35个苏氨酸的磷酸化位点,属于NHX1家族.说明己经在骆驼刺叶片中成功的克隆到Na+/H+逆向转运蛋白基因c DNA序列的部分片段,为下一步克隆骆驼刺叶片Na+/H+逆向转运蛋白基因的c DNA全序列提供了可能。

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喀什大学学报

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