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N-乙酰基-L-精氨酸-甲酰胺的理论构象分析

作者:谢惠定; 黄燕; 郭蕴苹; 柳波; 黄大荣构象分析空间结构

摘要:目的考虑到非键的和静电的相互作用、拓朴能和键角的变化,研究N-乙酰基-L-精氨酸-甲酰胺的空间结构.方法应用主链在低能构象和侧链在低拓朴能时φ,ψ,χ1-χ4的全部组合作为初始近似,完成了对分子的优势构象的计算,比较了精氨酸和赖氨酸的构象的可能性.结果计算获得的N-乙酰基-L-精氨酸-甲酰胺的稳定构象与在已知结构的蛋白质中的精氨酸残基的几何构型相符.结论精氨酸残基在蛋白质中构象即为精氨酸孤立单肽的优势构象。

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