作者:谢惠定; 邱开雄; 柳波; 简虹; 黄大荣构象分析空间结构
摘要:目的分析N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的非键和静电相互作用、拓朴能、键角的弯曲和氢键,研究它们的空间结构.方法当主链的最大构象可能性确定时,侧链的键角和两面角φ,ψ在每-点变化的情况下,用能量低化的方法得到了构象图,并评价了主链和侧链的空间的相互制约性.当主链为低能式而侧链具有最大拓朴势时,φ,ψ,x1-x5角的所有组合作为初始近似的情况下,计算了分子的优势构象.结果N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的稳定构象与赖氨酸残基在蛋白质中的已知结构的几何构型相符合.结论赖氨酸残基在蛋白质中构象即为赖氨酸孤立单肽的优势构象.
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