作者:闫莉莉; 于杰; 赵富丽; 洪敏; 程妍; 孟超赤鳞鱼线粒体dna系统树
摘要:通过对24条泰山赤鳞鱼DNA提取、PCR技术对线粒体D-loop序列进行扩增。PCR产物经纯化并进行序列测定后,得到的核苷酸片段约900bp。运用MEGA5.10软件计算其成对序列遗传距离,并根据D-loop序列建立了邻接法(Neighbor-Joining,NJ)系统树。通过DNASP软件计算出这24个个体的遗传多样性参数其多态性参数为:多态位点数(S)为71,单倍型个数(H)为19,单倍型多样性(h)为0.96,核苷酸多样性(π)为0.01112,平均核苷酸差异数(k)为8.739。研究发现泰山赤鳞鱼具有较高的单倍型多样性,但其核苷酸多样性较低。所构建NJ系统树拓扑结构基本一致,24个个体均形成两大分支,由于线粒体DNA属于母系遗传,由此可推断该群体的24个个体可能来源于两个不同的母系祖先。
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