作者:党江鹏 刘念 叶伟 黄原直翅目蝗总科云斑车蝗线粒体基因组rna二级结构重复序列
摘要:采用长距PCR扩增及保守引物步移法并结合克隆测序测定并注释了云斑车蝗Gastrimargus marmoratus(Tbunberg)的线粒体基因组全序列。结果表明:云斑车蝗线粒体基因组全序列为15904bp(GenBank登录号为EU527334),A+T含量略高于非洲飞蝗Locusta migratoria,为76.04%,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和一段1057bp的A+T富集区。蛋白质基因的起始密码子中,除COI和ND5为TTG以外,均为昆虫典型的起始密码子ATN。ND5基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均为典型的TAA或TAG。预测了22个tRNA基因的二级结构,发现tRNA^ser(AGN)缺少DIdU臂,tRNA^ser(UGY)的反密码子环上有9个碱基。预测了云斑车蝗12s和16SrRNA二级结构,分别包括3个结构域30个茎环和6个结构域44个茎环。A+T富集区含有3个串联重复序列。
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