作者:束振华; 陈思达; 范回生; 古聪慧; 黄震艰难梭菌荧光毛细管电泳数字化参考数据库
摘要:目的建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体基因分型方法并用于临床菌株的基因分型。方法利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考菌株构建常见基因型的数字化参考图谱,利用71株艰难梭菌临床菌株初步验证该方法的临床实用性。结果荧光毛细管电泳技术准确地检测出40株艰难梭菌参考菌株的PCR-核糖体分型片段,并以数字化的形式呈现出来,10种核糖体型艰难梭菌的PCR-核糖体分型数字化图谱差异明显。同为RT027的21株菌株间、RT002的3株菌株间和RT015的2株菌株间的数字化分型结果相似性都非常高,而7株RT001菌株则可分为4种亚型,2株RT014分为2种亚型。49株深圳地区儿童中分离出的艰难梭菌共分为22种核糖体型,其中RT017共7株,BA03和BA16各5株,BA13共4株。22株悉尼地区莫西沙星耐药的艰难梭菌均为高毒力核糖体型027(RT027)。结论成功建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法,同时构建了艰难梭菌10种核糖体型的数字化PCR-核糖体分型参考数据库;深圳地区婴幼儿中分离出的艰难梭菌基因型以RT017为主,与国内成人中的分离株相似。悉尼地区莫西沙星耐药的艰难梭菌均为高毒力RT027。
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