基于功率谱分析的外显子三周期特性的影响因素研究

作者：耶晓东; 张军英功率谱外显子三周期特性映射方法

摘要：针对不同长度外显子的三周期特性强弱不同,尤其是短外显子的三周期较弱的情况,利用Matlab软件建立了DNA序列外显子仿真模型。研究了外显子长度、碱基ATCG在密码子3个位置上出现的概率及不同映射方法对外显子三周期特性的影响。研究结果表明：当碱基ATCG在密码子的3个位置的概率一定时,随着外显子长度的增加,三周期特性会越来越明显,并具有一定的函数关系;当长度一定时,碱基ATCG在密码子的3个位置上出现的概率矩阵总分布方差越大,三周期特性越来越明显;不同数值映射方法对短外显子的三周期特性也有一定影响。研究结果可为外显子尤其是短外显子的有效检测提供参考。

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