木本高山花卉马缨杜鹃的全基因组扫描分析

作者：张露; 李世峰; 宋杰; 解玮佳; 彭绿春; 李...马缨杜鹃基因组大小杂合率gc含量重复序列

摘要：本研究采用高通量测序技术（Illumina Hiseq ~（TM）2000）首次对世界名贵园林花卉马缨杜鹃（Rhododendron delavayi）进行了基因组大小的测定,并评估了马缨杜鹃的GC含量、杂合率和序列重复度等信息参数,为马缨杜鹃全基因组测序策略的选择提供了有据参考。全基因组扫描结果如下：马缨杜鹃的基因组大小约为698 Mb,杂合率较高约为1.25%,GC含量约为39%,且具有一定的基因组序列重复度。研究表明：马缨杜鹃的全基因组测序分析不宜采用全基因组鸟枪法（WGS）,可尝试WGS与fosmid或BAC-to-BAC相结合的测序策略,亦或采用杂合组装软件进行序列拼装,以提高全基因组序列的拼装质量。

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