禾本科植物抗病基因增长的Logistic模型

作者：金玲; 王莉; 金殿川; 王金朋; 张岚抗病基因同源基因同义替换率logistic模型出生和死亡进化

摘要：运用生物信息学方法对水稻、高粱、二穗短柄草中抗病基因的数据进行分析,估算禾本科物种基因组对抗病基因的最大容纳量和抗病基因的增长率,建立了禾本科抗病基因的Logistic增长模型,并给出了估算原始抗病基因数量N0的方法,可以用于预测不同禾本科物种中抗病基因的增长趋势。利用该模型预测了禾本科物种玉米中抗病基因的增长趋势,得到玉米抗病基因的Logistic增长模型。Logistic模型预测当ks=0时玉米中抗病基因数量是99,而玉米中实际的抗病基因数量是97,Logistic模型预测的相对误差是2.06%。从玉米抗病基因家族的Logistic增长模型来看,玉米中抗病基因的增长过程分为四个阶段,分别为起步期、迅速增长期、成熟期、饱和期。目前玉米中抗病基因的增长正处于起步期,增长相对较慢,未来抗病基因的增长速度将不断增大,很快将会进入迅速增长期。

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