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基于变动窗口和移动序列的基因识别算法

作者:周朝栋; 张有全; 许竞文; 刘梦思变动窗口移动序列基因识别小波分析

摘要:采用信号处理技术来识别DNA碱基序列中的基因片段的方法,已经成为一种重要的基因识别途径,重新编码的DNA序列存在大量噪声信息,使得目前很多识别算法无法准确的识别外显子片段的起始位置。本研究通过对“固定长度滑动窗口-频谱曲线法”和“移动序列-信噪比法”的实现与改进,提出了一种基于变动窗口和移动序列的基因识别算法。首先,对已有基因识别算法进行编程实现;采用小波分析对识别结果进行消噪处理;探讨识别最优固定长度M的选择,提出基于变动窗口和移动序列的基因预测模型,并编程实现。最后使用该模型对已有基因序列进行识别,其识别准确度达到77.57%。

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基因组学与应用生物学

《基因组学与应用生物学》(CN:45-1369/Q)是一本有较高学术价值的大型月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《基因组学与应用生物学》获全国优秀高校学校自然科学学报;教育部优秀科技期刊;广西优秀科技期刊;中国期刊方阵“双效”期刊。

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