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芒果炭疽病菌小柱孢酮脱水酶基因SCD1的克隆与敲除载体构建

作者:刘娅楠; 蒲金基; 张贺; 周芳雪; 杨永利; ...芒果胶孢炭疽菌小柱孢酮脱水酶基因scd1克隆敲除载体

摘要:芒果炭疽病(Colletotrichum gloeosporioides)是为害芒果的重要病害之一,为了明确小柱孢酮脱水酶基因SCD1与芒果炭疽病菌致病力之间的相互关系,本研究以芒果炭疽病菌DNA为模板,利用同源克隆技术扩增SCD1,分析其序列特征、推测了其蛋白的保守结构域,并借助In—Fusion HD Cloning Kit技术进行敲除载体构建。结果表明,该基因DNA和cDNA全长分别为796bp、564bp,编码区有两个内含子(大小为52bp,180bp),推测编码187个氨基酸,其分子量约为21.52kD,等电点PI为5.90,与NCBI网站中已公布的基因进行Blastp比对,发现该序列与香蕉炭疽菌(C.musae)、无花果炭疽菌(C.caricae)(登录号:GQ266389.1,GQ266386.11的小柱孢酮脱水酶基因相似性分别为98%和97%。该基因的敲除载4]gpSCDGH-1已构建成功,为下一步获得5CD1基因敲除突变体,研究该基因功能打下了材料基础。

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基因组学与应用生物学

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