作者：邱军岭; 秦娟秀; 杨俊; 张灏旻化脓性链球菌msemm基因
摘要：目的 以基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术用于化脓性链球菌的快速鉴定,并利用主成分聚类分析构建树状图区分不同emm分型的化脓性链球菌菌株,探索MALDI-TOF MS方法对化脓性链球菌菌株鉴定和分型的可行性。方法 复苏临床分离到的49株化脓性链球菌,使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱,用biotyper软件进行菌种鉴定,利用主成分(PCA)聚类分析构建树状图(Dendrogram)对菌株分型,同时应用PCR扩增emm基因,测序确定化脓性链球菌的emm基因型别,将主成分聚类分析结果与化脓性链球菌emm分型结果比对。结果 MALDI-TOF MS方法鉴定结果均为化脓性链球菌,与传统方法鉴定结果均符合。emm基因测序结果显示49株化脓性链球菌中emm1为13株,emm12型为36株。通过对各菌株蛋白质质量图谱进行主成分聚类分析,在相对距离为1.1的情况下,分为A组(13株emm1型)和B组(36株emm12型),与测序结果一致。通过ClinproTools软件对A组和B组化脓性链球菌质谱图分析,有5个离子峰作为其分型的主要依据,分别是在5 545.89、6 912.47、6 898.61、5 518.51和2 978.02(m/z)离子质荷比处。结论 实验室可使用已知分型的菌株使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱并构建相应分型质谱图库,将待测菌株图谱与图库进行主成分聚类分析,通过构建树状图,可快速对化脓性链球菌emm进行分型。
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