作者：林毅; 洪雪梅; 关雄生物信息学对硫磷水解酶农药降解枯草杆菌基因组黄杆菌芽孢杆菌
摘要：以黄杆菌( Flavobacterium )对硫磷水解酶( parathion hydrolase)的序列(AAA24930.1)对芽孢杆菌的基因组进行BLASTP,从Bacillus halodurans中发现两个对硫磷水解酶类似蛋白PTEa和PTEb,长度分别为679和331个氨基酸.利用conserved domain search和motif scan软件分析的结果证实它们具有对硫磷水解酶的结构特征.PTEa和PTEb的对硫磷水解酶上游标志区分别是'GVCACHEHL'和'GFTYSHEHI',与标准的'G-x-T-L-x-H-E-H-[LIV]'大致吻合.PTEb的对硫磷水解酶下游标志区'AVARAHHETKAPIHSH'也与典型的'A-x-A-x-A-x(4) -G-x-P-[LIVM] -x(2) -H'基本一致,而PTEa中缺乏明显的下游标志区.PTEb序列对枯草杆菌基因组TBLASTN的结果表明枯草杆菌也可能存在对硫磷水解酶类似蛋白.
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