作者：潘冰心; 付汉江; 郑晓飞高通量测序细胞增殖基因组hct116细胞微rna
摘要：目的利用CRISPR/Cas9全基因组文库大规模筛选与细胞增殖相关的基因。方法将HCT 116细胞大规模培养至1×10~8个,将CRISPR/Cas9全基因组慢病毒文库大规模感染,加入嘌呤霉素筛选6 d后收集部分细胞,剩余细胞继续培养10 d,收取全部细胞,提取基因组DNA,扩增单链向导RNA(sgRNA)序列、建库并进行深度测序,比较前后两组sgRNA序列数据,根据sgRNA序列数量筛选出与细胞增殖相关的基因。结果与结论筛选出了一批与HCT 116细胞增殖相关的蛋白编码基因及miRNA基因,获得了增殖相关miRNA及其靶基因的调控网络,为进一步验证分析这些基因在HCT 116细胞中的功能奠定了基础。
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