作者：殷剑美; 王立; 蒋璐; 韩晓勇; 郭文琦; 李...芋流式细胞术基因组测序基因功能注释倍型水平基因组特征
摘要：采用流式细胞术,对2个芋[Colocasiaesculenta(L.)Schott]品种苏芋1号和香蕉芋的倍性水平和DNA含量进行了测定,2倍基因组DNA含量分别为7.71 pg和5.25 pg,倍性分别为三倍体和二倍体。同时通过HiSeq 2500测序,分别获得240.53 Gb和87.69 Gb数据,芋基因组大小为2.08~2.38 Gb,GC含量为42.57%~42.75%,杂合度为0.52%~2.29%。根据苏芋1号的基因组数据,组装得到基因组序列为2.27 Gb,Contig N50为359 bp;共注释获得24302个基因,99.43%的基因可注释到6个公共数据库;筛选出928987个SSR位点。
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