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基于SVM的microRNA计算识别方法研究

作者:孙萧寒 赵维mirnasvm机器学习生物信息学

摘要:microRNA(简称miRNA)是近年来发现的一类新的长约19-24nt的内源性非编码RNA,在动物和植物中发挥着重要而广泛的调控功能。它的发现主要有cDNA克隆预测和计算发现两条途径。由于cDNA克隆预测方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影响,而计算发现可以弥补其不足,因此miRNA的计算方法受到了广泛的重视。支持向量机作为一种优异的机器学习方法,因其良好的主动学习能力可应用于miRNA的预测。本文利用支持向量机方法对线虫miRNA进行预测,结果表明,该方法具有良好的正确率和敏感性。

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计算机与现代化

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